توفى العلامة فرج اللّه في مدينة النجف الأشرف عام 1386 ه / 1966 م ، وقد رثاه الأستاذ صالح الجعفري بقصيدة منها « 1 » : أو جز فلا واللّه ليس يلام * دهرا خف مصيبته حمام كره اللئام لقاءه متدرعا * وأحبه متجردون كرام ورثاه العلامة الشيخ عبد الغني الخضري بقصيدته ( شيخ الندى ) منها « 2 » : شيخ الندى وأبا الندى العامر * يزهو بكل محدث ومناظر وتسود في أركانه اضمامة * من كل قد يسمو وحبر شاعر يزهو بإسناد الحديث مسلسلا * عن عصمة من كل ناه آمر وأرخ وفاته العلامة الشيخ كاتب الطريحي بقوله « 3 » : قضى ( الرضا ) مخلفا * مآثرا معدده مسكنه الجنة والكوثر * صار مسكنه ما مات من تاريخه * ( آثاره مخلده ) وكان ولده الأستاذ جعفر فرج اللّه أديبا كاتبا ، وقد أخذ المقدمات عن أبيه ، وقد كتب ( نظرة سريعة في تاريخ النجف ) في مجلة العدل الإسلامي ، العدد الثامن ، السنة الثانية 1366 ه / 1947 م .

--> ( 1 ) الجعفري الديوان ص 284 . ( 2 ) الطريحي : مقدمة كتاب ( الإسلام والإيمان والفرق بينهما ) للشيخ محمد رضا فرج اللّه . ( 3 ) الأميني : معجم رجال الفكر والأدب في النجف ص 330 ، مصادر الدراسة عن النجف والشيخ الطوسي ص 62 .